软下疳的病原体是杜克雷嗜血杆菌，该菌为短而细的革兰氏阴性链杆菌(革兰氏染色是常用的一种染色方法，用来鉴别细菌，常分为革兰氏阳性和革兰氏阴性两种细菌，它对诊断和治疗用药都有帮助)，呈短棒状，两端圆，往往成双平行排列，无运动力，无芽孢。
软下疳的皮损特征：初起损害为炎性小丘疹，周围绕以红斑，1～2天后发展为脓疱扩大，破溃后形成多发性、凿形、坏死形，具有锯齿状潜蚀性痛性溃疡。溃疡表浅，底部有灰黄色猪油样脓苔，覆盖很多脓性分泌物，周围炎性红晕，触之柔软。下疳数目初期1～2个，因自身接种，周围可出现2～5个成簇卫星溃疡，一般经过10～60天愈合，愈合后留有瘢痕。
约有半数病例可伴发单侧(左侧多)腹股沟淋巴结炎及软下疳横痃。淋巴结肿痛，可形成单腔脓肿，有红肿热痛，波动感，即软下疳横痃，破溃后形成“鱼口”。女性患者很少形成溃疡和淋巴结炎。男性患者可因包皮长期反复发生炎症，使包皮口缩小，包皮与龟头形成粘连，不能翻转而成嵌顿包茎。也有因阴茎毁坏性溃疡侵及尿道，而致尿道狭窄，有时可同时伴有梅毒螺旋体感染或继发其他性病，如淋巴肉芽肿或腹股沟淋巴肉芽肿。
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