泌尿生殖系统感染的感染途径主要有3种，即上行感染、血行感染、淋巴感染
(1)泌尿生殖系统上行感染
致病菌由尿道口上行进入膀胱引起感染，膀胱内的致病菌经输尿管上行至肾脏则可引起肾盂肾炎。上行感染的致病菌以大肠杆菌最常见。在正常人，膀胱以上的尿路无细菌生长，后尿道亦基本无细菌，前尿道则有细菌寄生。因尿道粘膜本身有抵抗细菌侵袭的能力，并且常有尿流冲洗，故在正常情况下，一般不易致病。若经器械检查或导尿管导尿则可引起上行感染。女性发生上行感染的机会较多，这与女性局部解剖、生理特点有关。
(2)泌尿生殖系统血行感染
身体任何部位的细菌感染（如牙周炎、扁桃体炎、皮肤疖痈等）导致菌血症或败血症时，血流中的细菌到达肾实质，加上肾组织有某些缺陷或异常，则易引起肾盂肾炎。动物实验证明，在健康情况下，静脉注入病菌后，病菌很快被吞噬细胞吞噬或破坏，仅极少数经肾脏由尿排出；但当肾结构缺陷，血液障碍，或尿流不畅时，细菌可停留于肾内，形成肾盂肾炎。由此可见肾结构异常、尿流不畅是血行感染的致病条件。血行感染多数发病急骤，致病菌以球菌为主，尤以毒力强的金黄色葡萄球菌最为多见，常伴有肾脓肿。
(3)泌尿生殖系统淋巴感染
右升结肠与右肾之间有淋巴管相通。在患结肠炎时，细菌可经此淋巴管播散到肾脏。盆腔感染时细菌可经输尿管周围淋巴结到达膀胱或肾脏。膀胱、输尿管及肾脏淋巴管也是相通的，当膀胱内压增高，并有膀胱炎时，细菌可经过淋巴管进入肾脏，引起肾盂肾炎。
在以上3种感染途径中，最常见的是上行感染。而血行途径和淋巴途径引起的尿路感染较少发生。
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